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2025-01-14 01:03 | 星期二

Ovito在Linux中的界面操作

Ovito是一款功能强大的原子分子可视化及分析软件,它支持在Linux系统中进行界面操作。以下是在Linux中使用Ovito进行界面操作的基本步骤和一些高级技巧:

安装Ovito

  • 在Linux系统中,首先需要下载Ovito的安装包。对于Ubuntu系统,可以从OVITO官网下载适合Linux版本的安装包。
  • 下载完成后,解压安装包,并双击bin文件夹中的ovito可执行文件以运行Ovito。
  • 如果遇到权限问题,可以在命令前加上sudo。

界面操作基本步骤

  • 打开Ovito后,可以直接拖入LAMMPS的data输入文件或dump输出文件等,Ovito将显示模型。
  • Ovito支持多种分析功能,如Modifier分析和Pipeline分析,可以通过界面上的工具进行操作。
  • 进行空间平均作图等高级操作,可以通过界面上的Compute Property选项进行。

Ovito在Linux中的并行计算

  • Ovito支持在Linux中进行并行计算,可以通过命令行参数指定线程数来优化计算效率。
  • 例如,使用ovitos --nthreads 40 test.py命令可以指定使用40个线程进行计算。

Ovito的高级功能

  • Ovito支持空间平均作图,可以通过界面上的Compute Property选项和Color Coding功能实现,使原子应力云图分布更加均匀和美观。
  • Ovito还支持远程调用集群上的原子构型文件,可以在HPC Studio可视化平台上直接使用OVITO进行快速查看。

通过上述步骤,你可以在Linux系统中高效地使用Ovito进行原子分子可视化及分析。如果你需要更详细的使用指南或遇到问题,可以参考Ovito的官方文档或社区论坛。

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